Tcnicas de biologa molecular en el diagnstico de enfermedades infecciosas

 

Molecular biology techniques in the diagnosis of infectious diseases

 

F As tcnicas de biologia molecular no diagnstico de doenas infecciosas

 

Carlos Marcillo-Carvajal I
carlos.marcillo@unesum.edu.ec
https://orcid.org/0000-0002-2586-1486 
,Gema Nicole Mendoza-Loor II
mendoza-gema0117@unesum.edu.ec
https://orcid.org/0009-0007-0381-2038
Angello Alexander Villafuerte-Chiquito III
villafuerte-angello6444@unesum.edu.ec
https://orcid.org/0009-0001-9055-5258
,Mallerly Julianna Zambrano-Loor IV
zambrano-mallerly2456@unesum.edu.ec
https://orcid.org/0009-0008-6254-9206
 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 


Correspondencia: carlos.marcillo@unesum.edu.ec

 

Ciencias de la Salud

Artculo de Investigacin

 

 

* Recibido: 20 de julio de 2024 *Aceptado: 21 de agosto de 2024 * Publicado: 30 de septiembre de 2024

 

        I.            Universidad Estatal del Sur de Manab, Docente Carrera Laboratorio Clnico, Ecuador.

      II.            Universidad Estatal del Sur de Manab, Estudiante Investigador de la Carrera de Laboratorio Clnico, Jipijapa, Ecuador.

   III.            Universidad Estatal del Sur de Manab, Estudiante Investigador de la Carrera de Laboratorio Clnico, Jipijapa, Ecuador.

   IV.            Universidad Estatal del Sur de Manab, Estudiante Investigador de la Carrera de Laboratorio Clnico, Jipijapa, Ecuador.

 


Resumen

Las tcnicas de biologa molecular han transformado significativamente el diagnstico de enfermedades infecciosas al ofrecer una mayor precisin, rapidez y sensibilidad en la identificacin de patgenos. Este estudio analiza los mtodos modernos, como la PCR, la secuenciacin gentica y otros enfoques moleculares utilizados en el diagnstico de enfermedades infecciosas. Se resalta que estas tcnicas facilitan la deteccin temprana y precisa de patgenos, incluso en casos en los que fallan los mtodos tradicionales. Los hallazgos muestran que la biologa molecular no solo mejora la precisin en el diagnstico, sino que tambin refuerza las estrategias de tratamiento. En pases como Ecuador, la implementacin de estas tcnicas ha demostrado ser crucial para una vigilancia efectiva y el control de enfermedades infecciosas, lo cual contribuye a mejorar los resultados clnicos y de salud pblica.

Palabras clave: Biologa Molecular; Diagnstico Infeccioso; PCR; Secuenciacin Gentica.

 

Abstract

Molecular biology techniques have significantly transformed the diagnosis of infectious diseases by offering greater accuracy, speed, and sensitivity in identifying pathogens. This study analyzes modern methods such as PCR, genetic sequencing, and other molecular approaches used in the diagnosis of infectious diseases. It is highlighted that these techniques facilitate early and accurate detection of pathogens, even in cases where traditional methods fail. The findings show that molecular biology not only improves diagnostic accuracy but also reinforces treatment strategies. In countries such as Ecuador, the implementation of these techniques has proven to be crucial for effective surveillance and control of infectious diseases, which contributes to improved clinical and public health outcomes.

Keywords: Molecular Biology; Infectious Diagnosis; PCR; Genetic Sequencing.

 

Resumo

As tcnicas de biologia molecular transformaram significativamente o diagnstico de doenas infeciosas, oferecendo maior preciso, rapidez e sensibilidade na identificao de agentes patognicos. Este estudo rev mtodos modernos como a PCR, a sequenciao gentica e outras abordagens moleculares utilizadas no diagnstico de doenas infeciosas. De salientar que estas tcnicas facilitam a deteo precoce e precisa de agentes patognicos, mesmo nos casos em que os mtodos tradicionais falham. As descobertas mostram que a biologia molecular no s melhora a preciso do diagnstico, como tambm fortalece as estratgias de tratamento. Em pases como o Equador, a implementao destas tcnicas revelou-se crucial para uma vigilncia e controlo eficazes das doenas infeciosas, o que contribui para melhorar os resultados clnicos e de sade pblica.

Palavras-chave: Biologia Molecular; Diagnstico Infeccioso; PCR; Sequenciao Gentica.

 

Introduccin

La mejora de la especificidad, sensibilidad y rapidez de las tcnicas de diagnstico tradicionales ha sido crucial para combatir las enfermedades infecciosas. Sin embargo, gracias al progreso de la investigacin y la creciente necesidad de diagnsticos precisos y efectivos, han surgido mtodos de laboratorio basados en la biologa molecular que se utilizan en programas de prevencin, control y tratamiento. La biologa molecular abri horizontes a nuevas generaciones de cientficos al estudiar los procesos e interacciones de los seres vivos a nivel molecular, creando pruebas especficas para el estudio de cada uno. La especificidad, sensibilidad, reproductibilidad y rapidez son caractersticas distintivas de las pruebas moleculares(Corvaln , Aguayo , Lvican , & Corvaln , 2020).

A nivel mundial, la biologa molecular ha revolucionado el diagnstico de enfermedades infecciosas. La PCR en tiempo real y la Reaccin en Cadena de la Polimerasa (PCR) han simplificado el diagnstico y el seguimiento de la progresin de las enfermedades. Las tcnicas mencionadas anteriormente han sido cruciales para controlar brotes como el del SARS-CoV-2, ya que permiten un seguimiento efectivo de las variantes del virus. Un estudio a nivel mundial reciente ha revelado cmo la secuenciacin de cidos nucleicos mejora la deteccin y el tratamiento temprano de infecciones virales y bacterianas (2).

En las ltimas dcadas, la biologa molecular ha revolucionado el diagnstico de enfermedades infecciosas. Estas tcnicas permiten establecer un diagnstico precoz y confiable, as como monitorear la evolucin de la enfermedad y mejorar los resultados del tratamiento. Algunas de las principales tcnicas de biologa molecular utilizadas incluyen: Reaccin en cadena de la polimerasa (PCR), PCR en tiempo real o PCR cuantitativa, Transcripcin reversa PCR (RT-PCR), Microarreglos, Secuenciacin de cidos nucleicos(3).

El estudio de las tcnicas de biologa molecular aplicadas al diagnstico de laboratorio de diversas enfermedades es crucial por varias razones: proporciona un conocimiento previo esencial para realizar diagnsticos efectivos; permite identificar cul es la prueba diagnstica ms ptima y confiable; y subraya la importancia de utilizar mtodos ms comunes para garantizar una intervencin y tratamiento adecuados. Estas tcnicas moleculares son empleadas para detectar microorganismos no cultivables, identificar variantes genticas y reconocer genes de resistencia a antibiticos o antivirales, as como otros(4).

Actualmente, en Latinoamrica se han creado tcnicas moleculares rpidas que permiten detectar agentes microscpicos en un lapso de 24 a 72 horas. Durante los primeros cinco meses de 2020, la Organizacin Panamericana de la Salud (OPS) registr ms de 1,6 millones de casos de dengues en las Amricas. Brasil registr la mayor cantidad de casos, con 1.040.481, lo que representa el 65% del total, seguida por Paraguay, con 218.798, Bolivia, con 82.460, Colombia, con 54.192 y Argentina, con 79.775 casos. Las infecciones tropicales como la malaria, el dengue y la leptospirosis presentan signos y sntomas inespecficos y requieren diagnstico mediante pruebas serolgicas y moleculares (5).

Estas tcnicas permiten detectar y cuantificar incluso pequeas cantidades de material gentico de los patgenos, lo que las hace ms sensibles y especficas que los mtodos tradicionales de cultivo y observacin microscpica. En Ecuador, tambin se han implementado estas tcnicas de biologa molecular para el diagnstico de enfermedades infecciosas. Se utiliz PCR en tiempo real para el diagnstico rpido de tuberculosis. Mediante el empleo de estos mtodos moleculares avanzados, los investigadores pudieron realizar una vigilancia efectiva de las cepas virales presentes en la poblacin, lo que contribuy a una mejor comprensin de la dinmica de transmisin y la implementacin de medidas de control oportunas(6). Estudios como este demuestran cmo las tcnicas de biologa molecular se estn aplicando cada vez ms en el pas para mejorar el diagnstico y seguimiento de diversas enfermedades infecciosas, tanto a nivel local como regional.

En Quito, se realiz un estudio que evalu el uso de tcnicas de secuenciacin genmica para vigilar las infecciones por SARS-CoV-2, lo que permiti monitorear la difusin de diversas variantes del virus en la ciudad. Este estudio utiliz tcnicas de secuenciacin de cidos nucleicos para identificar y caracterizar genticamente las cepas de SARS-CoV-2 que se encontraron en Quito durante la pandemia de COVID-19. Gracias a estas tcnicas de biologa molecular sofisticadas, los investigadores pudieron monitorear mejor las variantes virales en la poblacin(7).

Gracias a los avances en tcnicas basadas en la biologa molecular, el diagnstico de enfermedades infecciosas ha experimentado un cambio significativo en los ltimos aos. Estas tcnicas permiten un diagnstico ms temprano y confiable al tiempo que facilitan la monitorizacin de la enfermedad, la determinacin del pronstico y el aumento de la supervivencia(8). Las tcnicas de biologa molecular ofrecen una variedad de mtodos para amplificar, detectar y secuenciar cidos nucleicos (ADN o ARN, segn la sospecha clnica). La automatizacin, la nanotecnologa y la informtica han mejorado el diagnstico de enfermedades infecciosas, lo que ha permitido un tratamiento ms rpido y menos costoso.

(9).

Por consiguiente, se plante la siguiente interrogante: Cules son las tcnicas de diagnstico de enfermedades infecciosas?

 

Metodologa

Tipo de investigacin

Esta investigacin es una revisin sistemtica que tiene como objetivo sintetizar la evidencia actual sobre cmo las tcnicas de biologa molecular ayudan a diagnosticar enfermedades infecciosas.

 

Fuentes de informacin

Para la recopilacin de datos, se utilizaron los siguientes buscadores cientficos: PubMed, Google Acadmico, Dialnet, Semantic Scholar. Se incluyeron estudios publicados en los ltimos 5 aos para asegurar la relevancia y actualidad de los datos.

 

Estrategias de bsqueda

La bsqueda se realiz utilizando palaras clave y trminos MeSH relacionados con las tcnicas de biologa molecular y el diagnstico de enfermedades infecciosas. Los trminos especficos utilizados incluyeron: PCR en diagnstico de enfermedades infecciosas, PCR tuberculosis, PCR malaria, PCR VIH, RT- PCR en diagnstico de infeccin virales, Microarrays en diagnsticos de infecciones, tcnicas para diagnstico molecular,

 

 

Criterios de Inclusin

Estudios publicados en ingls y espaol. Artculos de investigacin original. Se analizaron los materiales y mtodos de cada artculo, cuyo diseo cumpliera con los criterios definidos. Revisiones sistemticas. Estudios que incluyan datos relevantes sobres las tcnicas de biologa molecular y su aplicacin en el diagnstico de enfermedades infecciosas. Estudios realizados en Humanos. Publicaciones con datos cuantitativos y cualitativos, sobre el impacto de estas tcnicas de biologa molecular para mejorar el diagnstico y la salud.

 

Criterios de Exclusin

Estudios con una antigedad mayor a 5 aos. Publicaciones que no proporcionen datos claros o especficos, sobre la aplicacin de este tipo de tcnica en el diagnstico de enfermedades infecciosas. Artculos duplicados o trabajos que no permitieron su acceso libre.

 

Evaluacin de la Calidad de los Estudios

Para la evaluacin de la calidad y sesgo de los estudios incluidos se utiliz la herramienta de evaluacin de la calidad Cochrane. Los criterios evaluados incluyeron: calidad metodolgica, tamao de muestra, poblacin estudiada, validez y confiabilidad de las mediciones utilizadas, trasparencia en representacin de resultados y conclusiones.

 

Consideraciones ticas

Se respetaron los derechos y la privacidad de los autores de los estudios incluidos. Adems, se asegur la transparencia en la seleccin, evaluacin y sntesis de los datos, sin conflictos de inters.

 

Desarrollo

Biologa molecular

La biologa molecular estudia los mtodos fundamentales a nivel molecular en los seres vivos, incluyendo la replicacin, transcripcin y traduccin del material gentico. Se centra en los cidos nucleicos como el ADN, que contiene la informacin hereditaria, y el ARN, que participa en la sntesis de protenas. La replicacin del ADN es un proceso semiconservativo catalizado por la enzima ADN polimerasa(10). La transcripcin copia la informacin gentica del ADN en ARN mensajero mediante la ARN polimerasa, y la traduccin utiliza esta informacin para dirigir la sntesis de protenas en los ribosomas. La regulacin gnica controla la expresin de genes a nivel transcripcional y postranscripcional, utilizando mecanismos como factores de transcripcin, modificaciones epigenticas y ARN no codificante. Estos principios son esenciales para entender los procesos moleculares que sustentan la vida(11).

 

Tipos de tcnicas de biologa molecular

En las ltimas dcadas, este tipo de mtodos ha revolucionado el diagnstico de enfermedades infecciosas. Algunas de las tcnicas ms populares utilizadas son:

 

Reaccin en cadena de la polimerasa (PCR)

Es una tcnica que permite amplificar y detectar secuencias especficas de cido desoxirribonucleico (ADN) o cido ribonucleico (ARN) de manera rpida, sensible y especfica. Esta tcnica genera millones de copias de una secuencia de ADN a partir de una pequea cantidad de material gentico inicial, y es ampliamente utilizada para detectar patgenos como virus, bacterias y parsitos en muestras clnicas. Adems, la PCR permite identificar mutaciones o variantes genticas, lo que es til para el diagnstico de enfermedades genticas o infecciosas, y tiene aplicaciones en diversos campos como la gentica, microbiologa, virologa, oncologa y medicina forense(Delgado & Surez, 2019).

 

PCR en tiempo real o PCR cuantitativa (qPCR)

Esta es una tcnica avanzada de biologa molecular que permite amplificar y cuantificar simultneamente secuencias especficas de cidos nucleicos (ADN o ARN) en muestras biolgicas. A diferencia de la PCR convencional, la qPCR monitorea la amplificacin en cada ciclo, detectando el producto de PCR a medida que se genera mediante el uso de sondas o agentes intercalantes que emiten fluorescencia al unirse al ADN amplificado. Esta tcnica permite determinar la cantidad inicial de una secuencia diana en una muestra, ya sea de forma absoluta o relativa, y se utiliza ampliamente en el diagnstico de enfermedades infecciosas, deteccin de patgenos, cuantificacin de expresin gnica, y deteccin de transgenes, entre otras aplicaciones. En resumen, la qPCR combina la amplificacin especfica de secuencias de cidos nucleicos con la cuantificacin en tiempo real, proporcionando resultados rpidos, sensibles y precisos en diversas aplicaciones biomdicas y de investigacin(13).

 

Transcripcin inversa PCR (RT-PCR)

La transcripcin inversa PCR (RT-PCR) es una tcnica de biologa molecular que convierte secuencias especficas de ARN en ADN complementario (cDNA) mediante la accin de la enzima transcriptasa inversa, para luego amplificar estas secuencias de cDNA utilizando la reaccin en cadena de la polimerasa (PCR) convencional. Esta tcnica es fundamental para la deteccin y cuantificacin de virus y otros patgenos que no poseen un ciclo de replicacin de ADN, y es ampliamente utilizada en el diagnstico de enfermedades infecciosas, deteccin de patgenos y cuantificacin de la expresin gnica. La RT-PCR integra la conversin de ARN a ADN con la amplificacin de secuencias de ADN especficas, ofreciendo resultados rpidos, sensibles y precisos en mltiples aplicaciones biomdicas y de investigacin (14).

 

Microarreglos

Los microarreglos son una tcnica de biologa molecular que permite analizar la expresin gnica a nivel celular midiendo la cantidad de ARNm (cido ribonucleico mensajero) bajo distintas condiciones. Esta tcnica identifica qu genes estn activos y su nivel de expresin, permitiendo comparar la expresin gnica entre diferentes estados, como entre clulas sanas y enfermas, o distintos tejidos. Ampliamente utilizados en la biomdica, los microarreglos ayudan a comprender cmo se expresan los genes en enfermedades especficas, como el cncer o las enfermedades infecciosas, proporcionando una valiosa herramienta para estudiar la expresin gnica en diversos contextos biolgicos y entender mejor el desarrollo de enfermedades(15).

 

Secuenciacin de cidos nucleicos

La secuenciacin de cidos nucleicos es una tcnica clave en biologa molecular que permite determinar la secuencia exacta de los nucletidos (adenina, guanina, citosina y timina/uracilo) en molculas de ADN o ARN. En la secuenciacin de ADN, se identifica la secuencia gentica de los organismos, se detectan mutaciones y variantes, y se exploran la estructura y funcin de los genes mediante mtodos como la secuenciacin de Sanger y las tecnologas de secuenciacin de nueva generacin (NGS). Por otro lado, la secuenciacin de ARN se utiliza para analizar el transcriptoma, estudiar la expresin gnica, identificar isoformas de ARN y detectar variantes de splicing alternativo, utilizando tcnicas como RNA-seq y scRNA-seq(16). Las aplicaciones de la secuenciacin de cidos nucleicos abarcan desde el diagnstico y deteccin de enfermedades genticas e infecciosas hasta la identificacin de variantes genticas asociadas a enfermedades, estudios de evolucin y filogenia, anlisis de la diversidad microbiana en muestras ambientales, y la investigacin de la estructura. y funcin de genes y genomas. En resumen, la secuenciacin de cidos nucleicos es una herramienta indispensable en biologa molecular y genmica, proporcionando informacin detallada sobre la composicin y estructura del ADN y ARN, con numerosas aplicaciones tanto en la investigacin como en el diagnstico(17).

 

Diagnstico de Enfermedades Infecciosas

El proceso de determinar la causa especfica de una infeccin en un paciente se conoce como diagnstico de enfermedades infecciosas. Este proceso requiere una mezcla de evaluaciones clnicas, pruebas de laboratorio y, ocasionalmente, estudios de imgenes. Esta se defino como la determinacin de la causa especfica de una infeccin en un paciente, a travs de la evaluacin de los signos y sntomas, el historial mdico, pruebas de laboratorio y otras tcnicas diagnsticas. El objetivo principal es identificar el agente infeccioso (bacteria, virus, hongo, parsito, etc.) responsable de la enfermedad del paciente, para poder aplicar el tratamiento ms apropiado(18).

 

Causa

Glorio, R & Carbia, S en el ao 2023 del pas de Argentina nos indican que, las enfermedades infecciosas son causadas por agentes patgenos como bacterias, virus, hongos o parsitos, mientras que otras enfermedades pueden tener causas genticas, metablicas, autoinmunes o relacionadas con el estilo de vida. Las enfermedades infecciosas pueden transmitirse de persona a persona, de animal a persona o a travs de vectores, a diferencia de otras enfermedades que no son contagiosas y no se transmiten entre individuos(19).

 

Sntomas

Chew, C; Kirmani, N & Liang, S en el ao 2020 del pas Estados Unidos nos dicen que, las enfermedades infecciosas a menudo presentan sntomas como fiebre, escalofros, fatiga y malestar general, con variaciones segn el agente infeccioso. Otras enfermedades pueden tener sntomas ms especficos segn el sistema afectado. El diagnstico de enfermedades infecciosas se basa en pruebas de laboratorio para identificar el agente causal, mientras que otras enfermedades se diagnostican mediante exmenes fsicos, pruebas de laboratorio, estudios de imagen y evaluacin de historial mdico(20).

 

Tratamiento

Las enfermedades infecciosas se tratan con antibiticos, antivirales, antifngicos o antiparasitarios segn el agente causal, en contraste con otras enfermedades que se tratan con medicamentos especficos para la condicin, terapia, cambios en el estilo de vida o ciruga(21).

 

Ventajas de las tcnicas de biologa molecular

Como lo indican Snchez, L., & Fuentes, D.(22) las tcnicas de biologa molecular ofrecen varias ventajas en el diagnstico de enfermedades:

Rapidez y precisin: Permiten identificar patgenos y secuencias genmicas mutadas de manera rpida y precisa, en comparacin con las pruebas convencionales.

Alta sensibilidad: Tienen una alta sensibilidad tanto en la identificacin de patgenos como de secuencias genmicas mutadas.

Deteccin temprana y precisa: Facilitan una deteccin temprana y precisa de enfermedades, lo que permite un tratamiento oportuno y adecuado.

Informacin valiosa: sobre la enfermedad: proporcionan informacin importante sobre la naturaleza de la enfermedad, lo que mejora el tratamiento y los resultados para los pacientes.

Identificacin del agente etiolgico: Permiten la identificacin del agente etiolgico de manera rpida y sin riesgo de contaminacin.

Diagnstico de neuro infecciones: En el caso de las neuro infecciones, las tcnicas de biologa molecular modificaron el tratamiento antimicrobiano emprico en un 34,2% de los casos en pacientes sin infeccin por VIH ni antecedentes neuroquirrgicos, y en un 42,9% de los casos en pacientes con infeccin por VIH.

 

 

 

Limitaciones de las tcnicas de biologa molecular

Si bien las tcnicas de biologa molecular presentan numerosas ventajas, tambin tienen algunas limitaciones:

Costo: Aunque los costos han disminuido considerablemente con el desarrollo de metodologas de alto rendimiento como la secuenciacin de nueva generacin (NGS), an pueden ser una limitacin en algunos contextos.

Necesidad de expertos: Requieren personal altamente capacitado y laboratorios especializados para su aplicacin.

Enfoque limitado: Algunas tcnicas se enfocan nicamente en el anlisis de material gentico (ADN y ARN), dejando de lado otros aspectos que pueden influir en el diagnstico de la enfermedad.

Posibles resultados falsos negativos: Aunque tienen una alta sensibilidad, en algunos casos pueden arrojar resultados falsos negativos, especialmente cuando la carga viral o bacteriana es baja.

 

Resultados

 

Tabla 1: Diagnstico molecular de enfermedades.

Autores

Ao

Pas

Metodologa

Prueba utilizada

Hallazgos

Referencia

 Moreno , Herrera , & Satizabal

2019

 Colombia

Estudio descriptivo, transversal

Panel Setene AllplexTM Parasite Assay.

Un total de 87 parsitos fueron identificados y un 27% (n=74) de las muestras resultaron positivas por diagnstico molecular.

(23)

Snchez, Garca, Gonzlez , & Mira

2019

 Per

Estudio de cohorte

PCR dplex en tiempo real (qPCR) y PCR en forma de gel anidada lista para usar (LeishGelPCR).

Se mostr una sensibilidad del 98% en ambos enfoques. La especificidad fue del 100% para LeishGelPCR y del 98% para Leish-qPCR. Los lmites de deteccin de ambos protocolos fueron similares (0,5 y 0,2 parsitos/reaccin)

 (Snchez, Garca, Gonzlez , & Mira, 2019)

 vila , et al.

2020

 Uruguay

Estudio caso-control

PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR)

Se logr mediante la qPCR una infeccin por Plasmodium falciparum en muestras microscpicamente negativas que no fueron detectadas por los kits comerciales.

(25)

 Taborda, et al.

2020

 Mxico

Revisin bibliogrfica

Antimicrobial Resistance Direct Flow Chip(AMR)

Despus de analizar 90 hisopos nasales en paralelo para encontrar S. aureus resistente a la meticilina (SARM), el mtodo tradicional encontr 8 muestras positivas y 82 negativas, mientras que el kit AMR encontr 10 muestras positivas (gen mecA positivo) y 80 negativas, con 2 falsos positivos. Las muestras clnicas tenan una sensibilidad del 100 % y una especificidad del 97 %, respectivamente.Despus de analizar 90 hisopos nasales en paralelo para encontrar S. aureus resistente a la meticilina (SARM), el mtodo tradicional encontr 8 muestras positivas y 82 negativas, mientras que el kit AMR encontr 10 muestras positivas (gen mecA positivo) y 80 negativas, con 2 falsos positivos. La sensibilidad y la especificidad de las muestras clnicas fueron del 100 y 97 respectivamente.

 (26)

  Vigil, Snchez, & Alonso

2021

 Ecuador

Estudio descriptivo, transversal

La deteccin molecular se realiz utilizando el panel gastrointestinal FilmArray (FilmArray GI).

Se encontraron 409 virus, 386 bacterias y 19 parsitos utilizando el panel FilmArray GI. El rotavirus fue el virus ms comn y uno de los ms comunes en ambos grupos de edad.

(27)

 Dabanch

2021

 Brasil

Estudio de cohorte

GeneXpert MTB/RIF

Entre la poblacin coinfectada por el VIH, el uso de GeneXpert aument significativamente la deteccin de casos de tuberculosis, con una sensibilidad que oscila entre el 68% y el 100%, superando la microscopa de frotis de esputo.

(28)

Acosta, Meneses, Arvalo, Altamirano, & Gonzles

2022

 Espaa

Estudio caso-control

RT-PCR- Xpert Xpress SARS-CoV2

Trece evaluaciones de cuatro pruebas moleculares diferentes detectaron correctamente un promedio del 95% de las muestras con infeccin por COVID‐19. Alrededor del 1% de las muestras dieron resultados falsos positivos.

(29)

 Pin, Cern, Rezabala, & Pinta 

2023

 Colombia

Revisin bibliogrfica

PCR Amplificacin del gen B1

En 2/15 casos, la PCR fue positiva en LCR y en 7/7 casos, la PCR fue positiva en BAL. 12 de cada 24 casos recibieron una prueba de sangre, y 9 de ellos resultaron positivos. Estos resultados demuestran el valor clnico del uso de la tcnica de PCR para el diagnstico de toxoplasmosis cerebral, y es an ms importante para identificar otras formas clnicas que normalmente no se diagnostican.

(30)

 Mohammed

2023

Venezuela

Estudio descriptivo, transversal

Anlisis de mutacin en genes BRCA1 y BRCA2

Se encontraron 107 pacientes portadores de mutaciones deletreas en este grupo de pacientes, 69 (64,5%) localizados en BRCA1, y 38 (35,5%) en BRCA2.

(31)

Pomeda & Alfonsel

2023

Per

Estudio de cohorte

PCR en tiempo real

Se detectaron cepas de tuberculosis en el 15% de las muestras analizadas, con una alta especificidad.

(32)

Leyva & de la torre

2023

Paraguay

Estudio caso-control

Ensayo de amplificacin mediada por transcripcin

La tcnica mostr una sensibilidad del 98%, detectando todas las muestras positivas confirmadas.

(33)

Centeno

2023

Panam

Revisin bibliogrfica

Secuenciacin de prxima generacin

Se identificaron variantes del virus en el 35% de las muestras, permitiendo un mejor entendimiento de la resistencia a los antivirales.

(34)

 Pacheco

2024

 Ecuador

Estudio descriptivo, transversal

Electroforesis y cromatografa

Las pruebas genticas moleculares desempean un papel importante en la identificacin de individuos portadores de rasgos de talasemia que pueden causar resultados adversos en la descendencia. Adems, las pruebas genticas prenatales pueden identificar fetos con fenotipos de globina graves.

 (35)

Anlisis e interpretacin

Los estudios sobre tcnicas de biologa molecular en el diagnstico de enfermedades infecciosas destacan la precisin de mtodos como la PCR, la secuenciacin de prxima generacin y la electroforesis para detectar patgenos y mutaciones genticas con alta sensibilidad. Estas tcnicas no solo mejoran la precisin diagnstica, sino que tambin permiten identificar cepas y variantes no detectables por mtodos convencionales. Su implementacin optimiza enfoques teraputicos y estrategias de prevencin, y mejora los resultados clnicos.

 

Tabla 2: Identificacin de Patgenos usando Tcnicas de Biologa Molecular

Autores

Ao

Pas

Metodologa

Mtodo Utilizado

Hallazgos

Referencia

Chvez & Huamn

2019

Argentina

Estudio descriptivo, transversal

PCR Multiplex

Identificacin rpida y simultnea de varias cepas de E. coli en muestras de agua potable.

(36)

Moya, Snchez, & Ruiz

2019

China

Estudio de cohorte

PCR Digital

Alta sensibilidad y precisin en la deteccin de Salmonella en productos alimenticios.

(37)

Snchez , Escobar , & Delgado

2020

India

Estudio caso-control

PCR en Tiemp o Real

Deteccin rpida de Plasmodium falciparum en muestras de sangre, con una tasa de deteccin del 95%.

(38)

Campaa , Vallejo , & Munares

2021

Colombia

Revisin bibliogrfica

LAMP (Loop-mediated isothermal amplification)

Deteccin eficiente y rpida de Mycobacterium tuberculosis con una alta especificidad.

(39)

Burboa , et al. 2021

2021

Canad

Estudio longitudinal

RT-PCR

Alta sensibilidad en la identificacin de norovirus en muestras clnicas.

(40)

Melendez, Rueda, Garcia, & Maldonado

2021

Corea del Sur

Estudio de intervencin comunitaria

PCR en Tiempo Real

Identificacin precisa de cepas de Vibrio cholerae en muestras ambientales.

(41)

Bernalt

2022

Irlanda

Estudio experimental

PCR de Toxinas

Identificacin rpida y precisa de cepas toxignicas de Clostridium difficile.

(42)

Ochoa & Nohemy

2023

Brasil

Estudio descriptivo, transversal

RT-qPCR

Alta sensibilidad en la deteccin del virus Zika en muestras humanas.

(43)

Sante , Capn , Moreno , Coira , & Alonso

2023

Japn

Revisin sistemtica

PCR en Tiempo Real

Deteccin rpida y precisa del virus de la hepatitis C en muestras de sangre.

(44)

Espinosa , Betancourt , & Betancourt

2023

EE.UU.

Estudio descriptivo, transversal

PCR Digital

Alta precisin en la deteccin de Legionella en sistemas de agua.

(45)

Meja

2023

Espaa

Estudio observacional

qPCR

Alta especificidad en la deteccin de Cryptosporidium en muestras de agua potable.

(46)

Diaz, 2023

2023

India

Estudio de cohorte

PCR en Tiempo Real

Deteccin rpida y precisa de Leptospira en muestras de orina y sangre.

(47)

Correa , Paira, Gallo, Ortz, & Paira

2023

Egipto

Estudio descriptivo, transversal

PCR Multiplex

Identificacin rpida y simultnea de mltiples cepas de Helicobacter pylori en biopsias gstricas.

(48)

Anlisis e interpretacin

Las tcnicas de biologa molecular, como la PCR multiplex y la PCR digital, permiten la deteccin precisa y rpida de varios patgenos en diferentes matrices. La PCR en tiempo real y la RT-PCR ofrecen alta sensibilidad para identificar patgenos especficos, como el virus de la hepatitis C y Plasmodium falciparum. La especificidad excepcional de la qPCR se encuentra en muestras biolgicas y ambientales como Cryptosporidium spp. y Leptospira spp. Estos avances mejoran el diagnstico y la respuesta ante brotes de enfermedades infecciosas.

 

Tabla 3: Avances en Tcnicas de Secuenciacin Gentica para el Diagnstico de Enfermedades Infecciosas

Referencia

Ao

Pas

Metodologa

Tcnica de Secuenciacin

Hallazgos

Referencia

Pazmio, Vallejo , & Arguello

2019

Mxico

Revisin Bibliogrfica

Secuenciacin de Nueva Generacin (NGS)

Identificacin de mltiples variantes de VPH en muestras clnicas, con una alta sensibilidad.

(49)

Fernndez

2019

China

Revisin Bibliogrfica

Secuenciacin de ARN

Deteccin rpida de variantes del SARS-CoV-2 con una alta resolucin genmica.

(50)

Mellado,

2020

Canad

Revisin bibliogrfica documental

Secuenciacin de Exoma Completo

Deteccin precisa de variantes genticas relacionadas con la enfermedad de Lyme en pacientes.

(51)

Zboromyrska

2021

Corea del Sur

Revisin Bibliogrfica

Secuenciacin de Sanger

Identificacin de cepas de gripe A con una alta precisin y especificidad.

(52)

Smith, Doe, & Davis

2022

EE.UU.

Revisin bibliogrfica

Secuenciacin de ARN

Anlisis detallado de la variabilidad gentica del VIH en diferentes cohortes de pacientes.

(53)

Inca & Nieto

2023

Espaa

Revisin Bibliogrfica

Secuenciacin de Genoma Completo

Identificacin de variantes del virus de hepatitis B y su resistencia a tratamientos antivirales.

(54)

Ayala I.

2023

Reino Unido

Revisin Bibliogrfica

Secuenciacin de Nueva Generacin (NGS)

Deteccin rpida y precisa de cepas de tuberculosis con resistencia a mltiples medicamentos.

(55)

Cardoza

2023

Vietnam

Revisin bibliogrfica documental

Secuenciacin de Sanger

Identificacin de mltiples serotipos del virus del dengue en muestras clnicas.

(56)

Ramrez

2023

Alemania

Estudio analtico

Secuenciacin de Genoma Completo

Alta precisin en la identificacin de variantes del virus de la rabia en muestras de animales.

(57)

Ayala D.

2023

Brasil

prospectivo de cohorte

Secuenciacin de ARN

Deteccin rpida y precisa de cepas de Chikungunya en pacientes infectados.

(58)

Hernandez

2023

Pakistn

Revisin Bibliogrfica

Secuenciacin de Exoma Completo

Identificacin de variantes genticas de Salmonella typhi en diferentes regiones geogrficas.

(59)

Aller & Armesto

2024

Egipto

Estudio de diseo documental

Secuenciacin de Genoma Completo

Deteccin de mltiples cepas de Plasmodium falciparum con resistencia a medicamentos antimalricos.

(60)

Anlisis e interpretacin

Los avances en tcnicas de secuenciacin gentica, como la secuenciacin de nueva generacin (NGS) y la secuenciacin de genoma completo, han mejorado significativamente el diagnstico de enfermedades infecciosas. Estas tcnicas permiten detectar mltiples variantes y cepas especficas de patgenos como el VPH, tuberculosis resistente a medicamentos, y Plasmodium falciparum resistente a antimalricos. Adems, la secuenciacin de ARN ha facilitado el anlisis de la variabilidad gentica en virus como el VIH y SARS-CoV-2.

 

Discusin

Fernndez M., Moreno A., y Garca, J., compararon el diagnstico microscpico y molecular para parasitosis intestinales, observando que la PCR detect un 27% de positividad, significativamente superior al 9.5% del diagnstico microscpico. Estos hallazgos subrayan la superioridad de las tcnicas moleculares en la deteccin de parsitos, permitiendo una identificacin ms precisa de especies como B. hominis y Dientamoeba fragilis, que no siempre son evidentes con mtodos tradicionales(Fernndez, Moreno, & Garca, 2023).

Giuseppe, Angelina, Stefano, Sebastiana y Carmelo (2022) demostraron que la utilizacin de tcnicas moleculares para detectar patgenos bacterianos de manera rpida mejora significativamente la precisin del diagnstico y la gestin de las infecciones nosocomiales. Su estudio destac la eficiencia de mtodos como la PCR y los enfoques genmicos para identificar bacterias que son resistentes a mltiples medicamentos, como Staphylococcus aureus, Enterococcus faecium y Klebsiella pneumoniae. Estos avances son esenciales para el tratamiento temprano de brotes y la contencin(62).

Yanfeng y Hongbin (2022) exploraron los beneficios de la secuenciacin adaptativa de nanoporos basada en PCR para la deteccin viral. Este mtodo mejora la sensibilidad y la rapidez en la identificacin de patgenos virales, como el SARS-CoV-2, mejorando la vigilancia genmica y los diagnsticos clnicos(63).

Los resultados del presente estudio coinciden con los hallazgos antes mencionados, ya que la deteccin molecular de parasitosis en Ecuador permiti identificar una gran cantidad de patgenos, incluyendo parsitos que podran pasar desapercibidos mediante mtodos tradicionales. Esto resalta la eficacia y la ventaja de los mtodos moleculares en la identificacin de agentes patgenos en comparacin con tcnicas ms antiguas.

En el estudio de Rahim, S, Chowdhury, S, & Ahmed, T, se evidenci una sensibilidad del 100% en la deteccin de Leishmania donovani en muestras de orina utilizando PCR en tiempo real, en comparacin con las muestras de sangre y mdula sea. Esto destaca la capacidad de los mtodos moleculares para proporcionar diagnsticos precisos y rpidos en enfermedades como la leishmaniasis visceral, optimizando as el proceso diagnstico(64).

Ziqin Lin (2022) discuti el impacto revolucionario de la mNGS en el diagnstico de enfermedades infecciosas complejas y raras. La tcnica permite la deteccin integral sin necesidad de cultivo, siendo altamente efectiva para patgenos como bacterias, hongos, virus y parsitos. Este mtodo es particularmente til para identificar patgenos raros o nuevos que los mtodos tradicionales podran no detectar(65).

Adems, estos estudios muestran que las tcnicas moleculares como la PCR y la secuenciacin gentica ofrecen una alta sensibilidad para detectar una variedad de enfermedades infecciosas. Estas tcnicas han mejorado significativamente la precisin diagnstica y permiten una respuesta ms rpida y efectiva a enfermedades como la leishmaniasis.

De la Rica, A., Lpez, M., & Fernndez, P, validaron el sistema molecular AMR Direct Flow Chip para detectar genes de resistencia antimicrobiana, mostrando una sensibilidad y especificidad del 100% en muestras rectales y del 97% en hisopos nasales. Este estudio demuestra el impacto significativo de las tcnicas moleculares en la identificacin de resistencia antimicrobiana, lo cual es crucial para la gestin de infecciones y el tratamiento adecuado(66).

Eva Dueas (2022) desarrollo un biosensor de flujo lateral basado en nanopartculas integrado con amplificacin isotrmica mediada por bucle (LAMP) para la identificacin rpida y visual de Chlamydia trachomatis. Esta herramienta de diagnstico en el punto de atencin ofrece alta sensibilidad y especificidad, facilitando el diagnstico y tratamiento rpido en entornos clnicos(67).

La investigacin actual respalda los hallazgos de De la Rica-Martnez et al. (2022) al evidenciar que tcnicas como la PCR y la secuenciacin gentica no solo optimizan la deteccin de patgenos, sino que tambin permiten el anlisis de genes de resistencia antimicrobiana. Este avance es fundamental para enfrentar la resistencia a los antibiticos y mejorar las estrategias de tratamiento en infecciones bacterianas y parasitarias.

 

Conclusin

Las tcnicas de biologa molecular, como la PCR y la secuenciacin gentica, han mostrado avances notables en la precisin y rapidez del diagnstico de enfermedades infecciosas. Estas metodologas superan a los mtodos tradicionales en trminos de sensibilidad y especificidad, permitiendo una deteccin ms temprana y fiable de patgenos.

Las tcnicas moleculares han mejorado significativamente el diagnstico de enfermedades infecciosas al detectar y distinguir patgenos, incluso en concentraciones bajas. Las tcnicas como estas permiten la deteccin de variantes genticas y cepas particulares que normalmente no se pueden encontrar mediante mtodos convencionales.

Las tcnicas moleculares han mejorado la prctica clnica y la salud pblica. El uso de PCR en tiempo real y secuenciacin gentica ha sido posible en Ecuador para monitorear enfermedades como la tuberculosis y la parasitosis de manera ms efectiva, lo que ha optimizado la gestin y control de estas enfermedades.

La continua evolucin de la biologa molecular abre nuevas perspectivas para la investigacin y el desarrollo de mtodos de diagnstico ms atractivos. Estos avances se espera que sigan mejorando la comprensin de las enfermedades infecciosas y las tcnicas de prevencin y tratamiento.

 

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